Amtsbücher: u.a. Ratsprotokolle und Beschlussbücher (ab 1818), Rentmeisterumrittsprotokoll (1740-1755), Vormundschaftsbuch (1641-1681), Gemeindesteuer-Grundbuch (1820).

Rechnungen: u.a. 194 Marktkämmerei (1624-1817, mit Lücken), 70 Frühmess-Stiftung (1664-1820, mit Lücken), 51 Allerseelenbruderschaft (1637-1800, mit Lücken), 56 Zwölf-Apostel-Stiftung (1638-1821, mit Lücken), Rechnungsbuch über Spenden des Marktes (1644-1710).

Akten der kommunalen Verwaltung.

Sammlungen: u.a. ältere Drucke, Amts-, Gesetz- und Verordnungsblätter, Sterbebildchen.

Deposita: Motorsportclub Altomünster im ADAC, Archiv des ehemaligen Gemeindekrankenhauses, Schularchiv Wollomoos.

Archivgut der eingemeindeten Orte Hohenzell (1901-1978), Kiemertshofen (1845-1976), Oberzeitlbach (1889-1976), Pipinsried (18. Jh.-1978), Randelsried (bis 1976), Stumpfenbach (bis 1972), Thalhausen (1869-1978) und Wollomoos (1835-1978).